англійськафранцузькийіспанська

Запуск серверів | Ubuntu > | Fedora > |


Значок OnWorks

indigo-deco - онлайн в хмарі

Запустіть indigo-deco у постачальника безкоштовного хостингу OnWorks через Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS

Це команда indigo-deco, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS

ПРОГРАМА:

ІМ'Я


indigo-deco - виявлення каркаса молекул і деконволюція R-групи

СИНТАКСИС


індиго-деко файли [параметри]

індиго-деко -h

ОПИС


індиго-деко виконує виявлення каркаса молекул і деконволюцію R-групи. Прийнято
Формати: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES і CML.

ВАРІАНТИ


індиго-деко приймає наступні параметри.

-h Роздрукувати довідкове повідомлення

-a Розрахувати приблизний каркас (за замовчуванням точний)

-s
Запишіть максимум знайденого каркаса в molfile

-S
Запишіть усі знайдені каркаси в SD-файл

-l
Не обчислюйте каркас, а завантажуйте його з файлу

-старший
Запишіть каркас із R-сайтами у файл

-o
Запишіть отримані виділені молекули у файл

-r
Запишіть отримані молекули з розділеними r-групами у файл

створений Без урахування аромату

-- Позначає кінець варіантів

ПРИКЛАДИ


індиго-деко *.моль -o hl.sdf -s scaf.sdf
Прочитати молекули з molfiles у поточному каталозі, зберегти максимальну кількість знайдених каркасів
в scaf.mol і зберегти виділені молекули в hl.sdf.

індиго-деко структура.мол many.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
Прочитай одну молекулу з структуры.mol і кілька молекул із many.sdf, збережи
молекули з r-rgoups до rg.sdf і збережіть усі знайдені каркаси в allscafs.sdf.

індиго-деко *.smi -d readyscaf.mol -o hl.sdf
Прочитати декілька молекул із кожного файлу SMILES у поточному каталозі, прочитати
зберіть каркас із readyscaf.mol і збережіть виділені молекули в hl.sdf.

Використовуйте індиго-деко онлайн за допомогою служб onworks.net


Ad


Ad