Це команда libscanoute, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
libscanout - читає файл DHF і записує файл класів, згинів і найкращих результатів.
Надсім'ї.
СИНТАКСИС
libscanout -dhfinfile infile - вихідний файл вихідний файл
libscanout -допомога
ОПИС
libscanout — це програма командного рядка від EMBOSS («Європейська молекулярна біологія Open
Пакет програмного забезпечення»). Він є частиною командної групи (груп) "Білок: 3D-структура".
ВАРІАНТИ
вхід розділ
-dhfinfile infile
Цей параметр визначає розташування файлу DHF (файл звернення до домену) (вхід). А
«файл звернень домену» містить звернення до бази даних (послідовності) з класифікацією домену
інформацію у форматах FASTA або EMBL. Хіти є родичами сім'ї SCOP або CATH
і знаходять у результаті пошуку в базі даних послідовностей. Файли, що містять звернення, отримані за допомогою
PSIBLAST генеруються за допомогою SEQSEARCH.
Вимагається розділ
Вихід розділ
- вихідний файл вихідний файл
Цей параметр визначає розташування підсумкового файлу (виводу). Зведений файл
містить переліки доменних класів, надсімейств і сімей, упорядкованих за рангом на основі
балів (саме набрано першим).
Використовуйте libscanoute онлайн за допомогою служб onworks.net
