Це команда maskAlignedReads, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн емулятор Windows або онлайн емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
maskAlignedReads.py - Маскувати вирівняні читання у файлі regions
ОПИС
використання: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Використовуйте in.cmp.h5, щоб замаскувати відповідні регіони файлів у in.rgn.h5, записати вихід у новий
rgn.fofn.
позиційний аргументи:
inCmpFile
Вхідний файл cmp.h5.
inRgnFofn
Набір файлів таблиці вхідних регіонів.
outRgnFofn
Набір файлів таблиць вихідних регіонів.
необов'язковий аргументи:
-h, --допомога
показати це повідомлення довідки та вийти
-v, -- версія
показати номер версії програми та вийти
-l LOGFILE, --файл журналу LOGFILE
Вкажіть файл для входу. За замовчуванням stderr. (за замовчуванням: немає)
-d, --відлагоджувати
Збільшує докладність журналу (за замовчуванням: False)
-i, --інформація
Відображати інформаційні записи журналу (за замовчуванням: False)
Використовуйте maskAlignedReads онлайн за допомогою служб onworks.net