mia-2dmyocard-icaseries - онлайн у хмарі

ПРОГРАМА:

ІМ'Я

mia-2dmyocard-icaseries - Виконайте аналіз ICA на серії 2D-зображень

СИНТАКСИС

mia-2dmyocard-icaseries -i [параметри]

ОПИС

mia-2dmyocard-icaseries Ця програма використовується для запуску ICA на серії міокарда
перфузійні зображення, надані в наборі сегментації, щоб створити синтетичні посилання, які
можна використовувати для корекції руху шляхом реєстрації зображення. Якщо мета - забігти на повну
компенсації руху, тоді краще запустити mia-2dmyoica-nonrigid, оскільки ця програма
по суті те саме без реєстраційних бітів.

ВАРІАНТИ

Файл-IO
-i --in-file=(вхід, обов'язковий); рядок
вхідний набір перфузійних даних

-r --посилання=(виведення); рядок
База імен файлів для еталонних зображень. Тип зображення та схема нумерації є
взяті з вхідних зображень.

-c --save-cropped=(виведення); рядок
зберегти обрізаний набір вихідного набору в цей файл, файли зображень будуть використовуватися
основа імені як основа імені файлу

--save-feature=(виведення); рядок
зберегти зображення функцій, отримані з ICA, і деякі проміжні зображення
використовується для сегментації RV-LV із заданим іменем файлу, основою для файлів PNG.
Також збережіть коефіцієнти початкового найкращого та остаточного змішування IC
матриця.

Документи & інформація
-V --verbose=попередження
детальність виводу, друк повідомлень заданого рівня та вищих пріоритетів.
Підтримувані пріоритети, починаючи з найнижчого рівня:
інформація - Повідомлення низького рівня
простежувати ‐ Трасування виклику функції
невдача - Повідомляйте про помилки тестування
попередження - Попередження
помилка - Повідомити про помилки
відлагоджувати ‐ Вихід налагодження
повідомлення - Звичайні повідомлення
фатальний - Повідомляйте лише про фатальні помилки

-- авторське право
роздрукувати інформацію про авторські права

-h --допомога
роздрукувати цю довідку

-? --використання
надрукувати коротку довідку

-- версія
надрукувати номер версії та вийти

ICA
-C --components=0
Компоненти ICA 0 = автоматична оцінка Компоненти ICA 0 = автоматична
оцінка

-- нормалізувати
нормалізовані ІМС

--без смужки
не знімайте середнє з кривих змішування

-s --segscale=1.4
сегментувати та масштабувати поле обрізання навколо сегмента LV (0=без сегментації) і
масштабувати область обрізання навколо LV (0=без сегментації)

-k --пропуск=0
пропускати зображення на початку серії, як і інші
модальності пропускати зображення на початку серії, як і інші
модальності

-m --max-ica-iter=400
максимальна кількість ітерацій в ICAМаксимальна кількість ітерацій в ICA

-E --segmethod=функції
Метод сегментації
дельта-пік - відмінність зображень пікового посилення
риси - художні зображення
дельта-ознака - відмінність характерних зображень

Обробка
--threads=-1
Максимальна кількість потоків для обробки, це число має бути меншим
або дорівнює кількості ядер логічного процесора в машині. (-1:
автоматична оцінка).Максимальна кількість потоків для обробки,Це
число має бути меншим або дорівнювати кількості ядер логічного процесора в
машина. (-1: автоматична оцінка).

приклад

Оцініть синтетичні посилання з set segment.set і збережіть їх у refXXXX.??? за
використовуючи п’ять незалежних компонентів і пропускаючи 2 зображення. За замовчуванням обмежувальна рамка
навколо LV буде сегментовано та масштабовано на 1.4, а обрізані зображення будуть збережені в
обрізатиXXXX.??? і створюється набір сегментації cropped.set. Тип файлу зображення??? є
віднімається від вхідних зображень у segment.set.

mia-2dmyocard-icaseries -i segment.set -r ref -o ref -k 2 -C 5

АВТОР(и)

Герт Волний

АВТОРСЬКЕ

Авторське право на це програмне забезпечення (c) 1999-2015, Лейпциг, Німеччина та Мадрид, Іспанія. Воно приходить
без АБСОЛЮТНО НІ ГАРАНТІЙ, і ви можете розповсюджувати його відповідно до умов GNU
ЗАГАЛЬНА ПУБЛІЧНА ЛІЦЕНЗІЯ Версія 3 (або новіша). Для отримання додаткової інформації запустіть програму за допомогою
параметр '--copyright'.

Використовуйте mia-2dmyocard-icaseries онлайн за допомогою служб onworks.net