mincaverage - онлайн у хмарі

ПРОГРАМА:

ІМ'Я

mincaverage - середні файли minc

СИНТАКСИС

mincaverage [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc

ОПИС

Mincaredage усереднює файли minc разом. Допускається діапазон необов’язкової поведінки як
свердловина: попереднє нормування об’ємів, створення об’єму стандартного відхилення, усереднення за a
вказаний розмір вхідних файлів.

ВАРІАНТИ

Зауважте, що параметри можна вказувати в скороченому вигляді (якщо вони унікальні) і
можна вказати в будь-якому місці командного рядка.

Загальне опції

-2 Створіть вихідний файл формату MINC 2.0.

- клопітер
Перезаписати наявний файл.

-ноклоббер
Не перезаписувати наявний файл (за замовчуванням).

-вербозний
Роздрукувати інформацію про хід для кожного фрагмента скопійованих даних (за замовчуванням).

-спокійно Не роздруковуйте інформацію про прогрес.

-відлагоджувати Надрукуйте додаткову інформацію (наприклад, коефіцієнти нормалізації).

- список файлів ім'я файлу
Вкажіть файл, що містить список імен вхідних файлів. Якщо вказано «-», то файл
імена читаються зі стандартного входу. Якщо дана ця опція, то введення не повинно бути
імена файлів, зазначені в командному рядку. Порожні рядки у вхідному файлі є
ігнорується.

-max_buffer_size_in_kb розмір буфера
Вкажіть максимальний розмір внутрішніх буферів (в кбайтах). За замовчуванням 4096
кбайт.

Вихід тип опції

Ці параметри контролюють точність зберігання та розмір окремих значень вокселів у файлі
вихідний файл.

-тип файлу
Не виконуйте жодного перетворення типів (за замовчуванням).

-байт Запишіть 8-розрядні цілі значення.

- короткий Запишіть 16-розрядні цілі значення.

-інт Запишіть 32-розрядні цілі значення.

-довго Замінено на -int.

- плавати Запишіть значення з плаваючою комою одинарної точності.

- подвійний
Запишіть значення з плаваючою комою подвійної точності.

-підписано Запишіть значення у вигляді цілих чисел зі знаком (за замовчуванням для короткого та довгого). Проігноровано для
типи з плаваючою комою.

- без підпису
Запишіть значення у вигляді цілих чисел без знака (за замовчуванням для байта). Проігноровано через плаваючі
точкові види.

- діапазон хвилин Макс
визначає дійсний діапазон вихідних значень вокселів у їхньому цілочисельному представленні.
За замовчуванням – це повний діапазон для типу та знака. Цей параметр ігнорується для
значення з плаваючою комою. Щоб вона мала ефект, потрібно вказати тип.

Усереднення опції

- нормалізувати
Нормалізуйте обсяги до їх глобального середнього значення перед усередненням (на основі середнього
вокселів зі значенням більше ніж на 2 відсотки повного діапазону вище мінімального).

-ненормувати
Не нормалізувати гучність (за замовчуванням).

-sd-файл sdfile.mnc
Вкажіть ім’я вихідного файлу стандартного відхилення, який буде обчислено додатково
середнє, яке зазвичай обчислюється.

-файл ваги weightfile.mnc
Вкажіть вихідний файл сукупної ваги вокселів (за замовчуванням = немає).

-copy_header
Скопіюйте всю додаткову інформацію заголовка з першого вхідного файлу (за замовчуванням
для одного вхідного файлу).

-nocopy_header
Не копіюйте додаткову інформацію заголовка (за замовчуванням для багатьох вхідних файлів).

-авгдім темне ім'я
Укажіть назву виміру, за яким ми маємо проводити усереднення (або обчислення
стандартне відхилення). Якщо нормалізація виконана, вона все одно стосується лише окремих
тільки файли – нормалізація всередині файлу не виконується.

-бінаризувати
Перед обчисленням середнього значення вхідні об’єми двійнічать. Бінаризація виконана
шляхом визначення діапазону значень, які вносять 1 до середнього. Нормалізація
введення не дозволено під час виконання бінаризації.

-binrange хвилин Макс
Вкажіть діапазон значень для бінаризації.

-binvalue значення
Вкажіть єдине допустиме значення (ціле число) для бінаризації. Діапазон встановлений на +/-
0.5 навколо цього значення, щоб досягти ефективного округлення вхідних значень.

-ігнорувати_нижче значення
Не включайте воксели нижче цього значення в середній і sd

-ігнорувати_зверху значення
Не включайте воксели вище цього значення в середній і sd

- підлога значення
Синонім до -ігнорувати_нижче

-ігнорувати_зверху значення
Синонім до -ігнорувати_зверху

- ваги
Вкажіть ряд ваг для усереднення. Кількість вагових значень повинна
збігаються з кількістю вхідних файлів, а значення мають бути надані як єдині
аргумент із комами або пробілами як роздільники. Сума ваг має бути не-
нульовий. Якщо ваги використовуються із усередненим розміром, то може лише один вхідний файл
бути уточненим.

-width_weighted
Цей параметр можна використовувати лише під час усереднення по виміру (-авгдім варіант). Це
вказує, що зважування має здійснюватися за допомогою відповідної змінної ширини
до усередненої розмірності. Наприклад, використовуючи -width_weighted з -авгдім час
використовуватиме змінну ширини часу для зважування значень.

-мінімальна вага значення
Це визначає мінімальну вагу (кількість об’ємів, якщо не вказано вагу)
необхідно для обчислення дійсного середнього значення. Якщо сукупна вага воксела дорівнює
нижче цього порогу, середнє значення та SD буде 0. Зазвичай це було б
бути корисним, якщо значення виключаються за допомогою будь-якого з -ігнорувати параметрами або значеннями NaN
у вхідних обсягах.

-мін_вагова_частка значення
Такий же, як -мінімальна вага, але задається як частка суми введених ваг
(або кількість вхідних обсягів, якщо не вказано вагу).

Загальний опції та цінності всі команди:

-допомога Роздрукувати підсумок параметрів командного рядка та вийти.

-версія
Надрукуйте номер версії програми та вийдіть.

Використовуйте mincaverage онлайн за допомогою служб onworks.net