Це програма для Linux під назвою ADOMA, останню версію якої можна завантажити як adoma-1.0.tar.gz. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть цю програму під назвою ADOMA з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
ADOMA
ОПИС
ADOMA означає: Альтернативне відображення множинного вирівнювання. ADOMA може створити чотири різних відображення вирівнювання кількох послідовностей: вирівнювання ClustalW у форматі HTML, спрощене вирівнювання ClustalW у форматі HTML та/або txt та кольорове вирівнювання ClustalW у форматі HTML. Для прикладів цих вихідних файлів перегляньте знімки екрана. ADOMA використовує ClustalW для створення множинного вирівнювання з послідовностей ДНК або білків і відображає їх трохи інакше, ніж звичайний вихід ClustalW. ADOMA — це програма командного рядка, яку можна легко використовувати в конвеєрах.
Для отримання додаткової інформації перевірте README.md у розділі Файли.
Як процитувати ADOMA:
Zaal, D. and Nota, B. (2016), ADOMA: інструмент командного рядка для зміни результатів множинного вирівнювання ClustalW. Мол. інф., 35: 42–44. DOI: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Оболонка Unix, Python
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/adoma/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.