Це програма для Linux під назвою ArtificialFastqGenerator, останню версію якої можна завантажити як ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою ArtificialFastqGenerator з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
Штучний генератор Fastq
Ad
ОПИС
ArtificialFastqGenerator приймає еталонний геном (у форматі FASTA) як вхідні дані та виводить штучні файли FASTQ у форматі Sanger. Він може приймати базові оцінки якості Phred з існуючих файлів FASTQ і використовувати їх для імітації помилок послідовності. Оскільки штучні FASTQ є похідними від референтного геному, референтний геном забезпечує золотий стандарт для виклику варіантів (однонуклеотидні поліморфізми (SNP) та вставки та делеції (індели)). Це дозволяє оцінити конвеєр аналізу секвенування наступного покоління (NGS), який узгоджує зчитування з еталонним геномом, а потім викликає варіанти.Аудиторія
Промисловість охорони здоров’я, наука/дослідження, досвідчені кінцеві користувачі
Мова програмування
Java
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.