Це програма для Linux під назвою Auto Primer3, останню версію якої можна завантажити як AutoPrimer3-3.0.2_installer.exe. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть цю програму під назвою Auto Primer3 з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
Автопраймер3
ОПИС
ЗВЕРНІТЬ УВАГУ: ЦЯ СТОРІНКА ПРОЕКТУ БОЛЬШЕ НЕ ОНОВЛЯЄТЬСЯ - БУДЬ ЛАСКА, Скористайтеся сторінкою GITHUB (https://github.com/gantzgraf/autoprimer3) ЩОБ ЗНАЙТИ ОСНОВНІЙ ВИПУСК (https://github.com/gantzgraf/autoprimer3/releases/latest).
AutoPrimer3 отримує інформацію про гени, послідовності ДНК та інформацію про SNP із браузера геному UCSC і використовує primer3 для автоматичного проектування праймерів до генів або цілей геномних координат.
Праймери можуть бути розроблені з використанням інформації з будь-якого генома, розміщеного в UCSC, і праймери можуть бути виготовлені, щоб уникнути перекриття SNP для геномів, де доступні бази даних SNP.
риси
- Автоматичне проектування праймерів до генів, транскриптів або геномних координат
- Завантажуйте файли BED або VCF і створюйте праймери за вказаними координатами
- Експорт вихідних даних праймера у файли .txt, .csv або .xlsx
- Автоматично уникайте створення праймерів поверх відомих SNP
- Автоматично перевіряйте результати ПЛР in-silico для розроблених пар
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
JavaFX
Мова програмування
Java
Категорії
Це програма, яку також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/autoprimer3/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було найпростіше запускати онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.