Це програма для Linux під назвою bspipe, останню версію якої можна завантажити як bspipe-1.3.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою bspipe з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
bspipe
Ad
ОПИС
BSpipe — це комплексний конвеєр від контролю якості послідовності та відображення до функціонального аналізу диференційовано метильованих областей:
(1) оцінка якості послідовності,
(2) послідовне очищення,
(3) відображення послідовності читання,
(4) кількісна оцінка метилювання,
(4) порівняння зразків на основі профілю метилювання,
(5) ідентифікація DMR (диференційно метиловані області),
(6) анотація DMR,
(7) функціональний аналіз диференційовано метильованих генів,
(8) генерація вхідних файлів для візуалізації, і
(9) підтримка передових технологій секвенування, таких як TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it і NOMe-seq.
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Unix Shell, Perl, S/R
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/bspipe/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
