Це програма для Linux під назвою ForceGen, останню версію якої можна завантажити як ForceGenV0.4.jar. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою ForceGen з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
ForceGen
ОПИС
Будь ласка, процитуйте:ForceGen: виведення константи атомного ковалентного зв’язку для Gromacs. Неш А, Кольєр Т, Берч Х.Л., де Леу Н.Х. Журнал молекулярного моделювання (2018), (24)5. DOI: 10.1007/s00894-017-3530-6
Відео з інструкцією:
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg
Цей виконуваний файл Java отримує константи сили зв’язку другого порядку для розтягування зв’язку та кута зв’язку з квантовомеханічних гауссових розрахунків. Розрахунки сумісні з сімейством силових полів Amber або будь-яким силовим полем, отриманим з тензора Гессе другого порядку з молекулярних фрагментів. Вихід був сумісний з форматом топології Gromacs.
Приклади використання включають виведення констант сили зв’язку та значень рівноваги для:
-зв'язані метали в білкових активних центрах
-модифіковані амінокислоти
-малі молекули/молекули ліків
Зіп-файл із прикладами файлів можна знайти, перейшовши за посиланням «Переглянути всі файли».
Автор д-ра Ентоні Неша (Оксфорд)
За підтримки доктора Томаса Кольєра, професора Хелен Бірч та
риси
- Виведення постійної сили розтягування зв'язку
- Виведення постійної сили кута зв'язку
- Сумісність з топологією Gromacs
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/forcegen/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.