Це програма для Linux під назвою Generalized Pattern Matching, останню версію якої можна завантажити як longpattern.exe. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та безкоштовно запустіть онлайн цю програму під назвою Generalized Pattern Matching with OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
Узагальнений шаблон
Ad
ОПИС
Цей інструмент призначений для вирішення узагальненої проблеми зіставлення шаблонів, за допомогою якої ми знаходимо лише набір підшаблонів, ігноруючи проміжки між підшаблонами. Цей інструмент надзвичайно швидкий, а також має хорошу стійкість до помилок.
риси
- зіставлення шаблону в геномі людини менш ніж за одну хвилину
- індекс k-mers на основі жорсткого диска
- комплементарний подвійний посів
- обрізаний ДП в подовженні
- коротка довжина насіння k має хорошу толерантність до помилок
- можна усунути як позитивні, так і негативні прогалини
Аудиторія
Розширені кінцеві користувачі
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
C
Середовище бази даних
Інший API
Категорії
Це додаток, який також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/gpatternmatch/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було найпростіше запускати онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.