Це програма для Linux під назвою JSiteDescriptor, останню версію якої можна завантажити як binaries.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою JSiteDescriptor з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
JSiteDescriptor
Ad
ОПИС
Набір програм Java, які витягують координатну та хімічну інформацію з файлів PDB.
Ділянки сайту зв'язування виділяють за допомогою схеми на основі сітки.
Для сайту зв’язування просторово-хімічний дескриптор генерується на основі алгоритму PocketMatch доктора Калідаса (також автора цього проекту).
Функції
- Генерація векторного дескриптора на основі PocketMatch для сайту прив’язки
- Запуск у режимі одного файлу PDB або пакетному режимі
- Специфікація сайту як сусідства ліганду - (код ліганду, назва та ідентифікатор ланцюга)
- Специфікація сайту як околиці підмножини PDB за допомогою РЕГУЛЯРНИХ ВИРАЗІВ
- Уточнення кількох діапазонів атомів, що вистилають сайт зв’язування
- Файл пакетної обробки фіксує вхідні параметри через файл XML + відповідно до специфікації XSD
- Більша конфігураційність – вибір групи залишків, радіусу та категорій для сайтів
- Технологія Java Swing для графічного інтерфейсу
- Проста та розширювана архітектура програмного забезпечення для майбутньої розробки
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Java Swing
Мова програмування
Java
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
