Це програма для Linux під назвою MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, останню версію якої можна завантажити як meta_phat.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою MetaPhat -meta-pheno-association-tracker з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
MetaPhat -мета-фено-асоціація-трекер
ОПИС
MetaPhat є активним інструментом з відкритим кодом (ліцензія MIT) для виявлення варіантів із багатоваріантними асоціаціями за допомогою підсумкової статистики з одновимірних досліджень GWAS. Додаток також виконує декомпозицію, знаходячи оптимальні підмножини BIC і риси драйвера P-значення для багатоваріантних варіантів відведення. Результати варіантів простежуються та групуються, щоб допомогти розібрати взаємозв’язки фенотипи-генотипи.Будь ласка, перегляньте нашу домашню вікі, щоб отримати інструкції зі встановлення, необхідні формати даних GWAS та приклади введення за допомогою команди test - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Приклад глобальних ліпідів (GLGC, Willer 2013) та джерела смол - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Якщо у вас виникли проблеми або виникли запити на функції після спроби прикладу та прочитання підручника, надішліть електронний лист: [захищено електронною поштою]
Авторські права <2019> [захищено електронною поштою], [захищено електронною поштою]
Функції
- багатоваріантний аналіз ознак у всьому геномі
- Оптимальний вибір підмножини ознак на основі p-значення та BIC
- графіки розкладання ознак
- Зведений файл SNP і драйвера
- snp-snp кластер списоносців
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
