Це програма для Linux під назвою metasort для запуску в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як metaSort.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою metasort для безкоштовного запуску в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
metasort для запуску в Linux онлайн
ОПИС
Більшість сучасних підходів аналізують метагеномні дані за участю еталонних геномів. Однак нові мікробні спільноти виходять далеко за межі охоплення довідкових баз даних, і збирання метагеномів de novo зі складних мікробних спільнот все ще залишається великою проблемою. Тут ми представляємо нову експериментальну та біоінформаційну структуру, metaSort, для ефективного конструювання бактеріальних геномів із метагеномних зразків. MetaSort забезпечує відсортований міні-метагеномний підхід, заснований на методології проточної цитометрії та одноклітинного секвенування, а також використовує нові обчислювальні алгоритми для ефективного відновлення високоякісних геномів із відсортованого міні-метагенома за допомогою комплементарного до вихідного метагенома. Завдяки розширеній оцінці змодельованого набору даних, мікробіомів слини та кишечника ми продемонстрували, що metaSort має чудову та неупереджену роботу щодо відновлення та складання геному.Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/metasort/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
