Це програма для Linux під назвою MoPAC, останню версію якої можна завантажити як MoPAC_0.3.1.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою MoPAC з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
MoPAC
ОПИС
Щоб полегшити порівняння істотності генів у двох або більше зразках клітин, ми пропонуємо MoPAC (Модульний конвеєр для аналізу екранів CRISPR), інтерактивний інструмент, керований Shiny, для аналізу диференційної сутності в екранах CRISPR/Cas9.
Щоб отримати інструкції щодо встановлення та використання, перейдіть на сторінку вікі.
Функції
- Неупереджене вимірювання диференціальної істотності генів у екранах CRISPR.
- Простота використання завдяки інтерактивному графічному інтерфазі користувача.
- Підготовлені до публікації цифри, які генеруються на кожному кроці аналізу.
- Як файли FASTQ, так і таблиці підрахунку читання (до або після нормалізації) дозволені як вхідні дані.
- Контроль якості на основі генних категорій для виявлення і фільтрації викидів.
- Аналіз генної онтології, вбудований через пакет STRINGdb R.
- Швидка обробка за допомогою компіляції кроків із інтенсивними обчисленнями на C++.
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Веб-
Мова програмування
C++, S/R
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/mopac/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
