Це програма для Linux під назвою PARSEC - PAttern SEarch / Context, останню версію якої можна завантажити як PARSEC_Deployment_Package_v2.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою PARSEC - PAtterRn SEarch / Context з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
PARSEC - ПОШУК ЗА ПАЗОРОМ / Контекст
ОПИС
Характеристика геномних сайтів є основною проблемою в розумінні та використанні даних секвенування наступного покоління. Більшість геномних сайтів представлені короткими виродженими мотивами з розсіяним розподілом, а іноді і з біологічною функцією (наприклад, регуляція експресії генів, моделі сплайсингу або епігенетичні сигнали). Ці мотиви пов’язані з величезною кількістю шуму, і, таким чином, розробка обчислювальної платформи для точного виявлення геномних сайтів вимагає інтеграції різноманітних великомасштабних біологічних даних, щоб відфільтрувати помилкові результати.
PARSEC являє собою інтуїтивно зрозуміле, модульне (легко розширюване) і все-в-одному рішення для ефективної інтеграції великої кількості різноманітної геномної інформації для виконання нелінійної локалізації та характеристики біологічних сайтів у зручному середовищі.
Вимоги до обладнання та підтримувані браузери див. у вікі.
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Веб-
Мова програмування
C++, Java
Середовище бази даних
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pgsql)
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
