Це програма для Linux під назвою pipasic, останню версію якої можна завантажити як README.txt. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою pipasic з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
піпасик
ОПИС
Метапротеомний аналіз дозволяє вивчати взаємодію організмів або функціональних груп і стає все більш популярним також для діагностичних цілей. Однак труднощі виникають через високу схожість послідовностей між спорідненими організмами. Крім того, стан збереження білків між видами може корелювати з рівнем їх експресії, що може призвести до значного упередження в результатах та інтерпретації. Ці проблеми подібні, але не ідентичні проблемам, що виникають при аналізі метагеномних зразків, і вимагають конкретних рішень.
pipasic (корекція подібності протеомної кількості, зваженої за інтенсивністю пептидів) – це інструмент, який коригує результати кількісної оцінки на основі ідентифікації та спектрального підрахунку за допомогою оцінки подібності пептидів та зважування рівня експресії в рамках невід’ємного ласо. pipasic має явні переваги перед підходами лише щодо унікальних пептидів або агрегування результатів до найнижчого спільного предка.
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Python
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/pipasic/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
