Це програма для Linux під назвою PPSeq: Parallel NGS Analysis для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою PPSeq: Parallel NGS Analysis, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
PPSeq: паралельний аналіз NGS для запуску в Linux онлайн
ОПИС
Високопродуктивна технологія секвенування нового покоління (NGS) швидко стала потужним інструментом у багатьох аспектах біомедичних досліджень. Однак, разом із швидким розвитком, обсяг даних і складність аналізу для NGS значно перевищують потужність і можливості традиційних невеликих обчислювальних засобів, таких як багатопотокові алгоритми на автономних робочих станціях. Щоб вирішити цю проблему, тут ми представляємо рішення, яке використовує постійно зростаючу потужність обробки за допомогою систем масивної паралельної обробки (MPP).риси
- ppalgn - вирівнювання послідовності читання до довгих еталонних послідовностей
- ppbwt - побудова FM-індексу з набору послідовностей ДНК
Аудиторія
Освіта, інженерія, галузь охорони здоров'я, інформаційні технології, неприбуткові організації, наука/дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
C + +
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/ppseq/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
