Це програма для Linux під назвою QSdpR для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як QSdpR_v3.2.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою QSdpR, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
QSdpR для запуску в Linux онлайн
Ad
ОПИС
Це програмне забезпечення для реконструкції вірусних квазівидів для задачі збирання квазівидів на вірусах мРНК, яке засноване на підході кореляційної кластеризації та використовує структуру напіввизначеної оптимізації. Програмне забезпечення приймає еталонний геном, набір зчитування NGS, вирівняний з цим посиланням, і набір місць розташування SNP у вигляді файлу vcf і виводить оптимальний набір відновлених геномів видів, який описує основну вірусну популяцію.Функції
- Квазівиди
- мРНК вірус
- Кластеризація
- Напіввизначена програма
- Вірус ВІЛ-1
Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Оболонка Unix, Python, C
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/qsdpr/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.