Це програма для Linux під назвою qure, останню версію якої можна завантажити як QuRe_v0.99971.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою qure з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
qure
ОПИС
QuRe — це програма для реконструкції вірусних квазівидів, спеціально розроблена для аналізу довгочитаних (>100 bp) даних NGS. Програмне забезпечення виконує вирівнювання фрагментів послідовності щодо еталонного геному, знаходить оптимальний поділ геному на ковзаючі вікна на основі охоплення та різноманітності та намагається відновити всі окремі послідовності вірусних квазівидів — разом із їхньою поширеністю — за допомогою евристичного методу. алгоритм, який узгоджує мультиноміальні розподіли різних вірусних варіантів, що перекриваються по відділу геному. QuRe має вбудований метод корекції помилок Пуассона та імовірнісну кластеризацію після реконструкції, які параметризовані на заданих частотах помилок у гомополімерних та негомополімерних областях.Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/qure/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
