Це програма для Windows під назвою nichenetr, останню версію якої можна завантажити як v2.0.4.zip. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть цю програму під назвою nichenetr з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
ЕКРАНИ
Ad
ніченетр
ОПИС
nichenetr: реалізація R методу NicheNet. Метою NicheNet є вивчення міжклітинної комунікації з обчислювальної точки зору. NicheNet використовує дані експресії генів людини або миші взаємодіючих клітин як вхідні дані та поєднує їх із попередньою моделлю, яка об’єднує наявні знання про шляхи передачі сигналів від ліганду до мішені. Це дозволяє передбачити взаємодії ліганд-рецептор, які можуть викликати зміни експресії генів у цікавих клітинах. Ця модель попередньої інформації про потенційні зв’язки ліганд-мішень може бути використана для висновку про активні зв’язки ліганд-мішень між взаємодіючими клітинами. NicheNet визначає пріоритетність лігандів відповідно до їхньої активності (тобто, наскільки добре вони передбачають спостережувані зміни в експресії генів у клітині-приймачі) і шукає уражені мішені з високим потенціалом для регулювання цими пріоритетними лігандами.
риси
- NicheNet сильно відрізняється від більшості сучасних обчислювальних підходів до вивчення міжклітинної комунікації
- Оцініть, наскільки добре ліганди, що експресуються клітиною-відправником, можуть передбачити зміни в експресії генів у клітині-приймачі, визначаючи пріоритетність лігандів на основі їх впливу на експресію генів
- Виведіть передбачувані зв’язки ліганд-мішень, активні в досліджуваній системі
- Перевірте попередню модель ліганд-мішень
- Побудова визначених користувачем попередніх моделей ліганд-мішень
- Ми надаємо інструкції, як зробити інтуїтивно зрозумілу візуалізацію основних прогнозів
Мова програмування
R
Категорії
Це програма, яку також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/nichenetr.mirror/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було найпростіше запускати онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
