Це програма для Windows під назвою Scaffold_Builder, останню версію якої можна завантажити як scaffold_builder_v2.2.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою Scaffold_Builder з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
ЕКРАНИ
Ad
Будівник_риштувань
ОПИС
Scaffold_builder — це програмне забезпечення для впорядкування контигів, що генеруються шляхом секвенування чорнових частин уздовж еталонної послідовності. Пропуски заповнюються символами N, а невеликі перекриття узгоджуються з алгоритмом Нідлмана–Вунша та консенсусом, створеним за допомогою кодів IUPAC. Scaffold_builder може допомогти в збиранні та анотації геномів, виявляючи те, чого не вистачає, і дозволяючи цільовому секвенування закрити ці прогалини.(c) Сільва Г.Г., Дутіл Б.Є., Метьюз Т.Д., Елкінс К., Шмідер Р., Дінсдейл Е.А., Едвардс Р.А.
Будь ласка, процитуйте: «Комбінація де-нового та реферативного складання за допомогою Scaffold_builder», вихідний код для біології та медицини 2013.
риси
- ешафот
- проект геному
- біоінформатики
Користувацький інтерфейс
Веб-орієнтований, командний рядок
Мова програмування
Python
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/scaffold-b/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
