cmtk-dwi_mask_bad_slices - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

dwi_mask_bad_slices - Tìm các lát xấu trong tập hợp các hình ảnh có trọng số khuếch tán.

SYNOPSIS

dwi_mask_bad_slices Đường dẫn hình ảnh khuếch tán

MÔ TẢ

Công cụ này đọc một tập hợp các hình ảnh MR có trọng số khuếch tán 3D và tìm ra các lát cắt xấu. Một lát xấu
trong một hình ảnh khuếch tán được phát hiện là một hình ảnh có cường độ trung bình nằm ngoài một
khoảng giá trị xung quanh giá trị trung bình của tất cả các lát tương ứng từ phần còn lại
hình ảnh khuếch tán.

LỰA CHỌN

Toàn cầu Toolkit Các lựa chọn (những đang chia sẻ by tất cả các CMTK công cụ)
--Cứu giúp
Viết danh sách các tùy chọn dòng lệnh cơ bản vào đầu ra tiêu chuẩn.

- trợ giúp tất cả
Viết danh sách đầy đủ các tùy chọn dòng lệnh cơ bản và nâng cao vào đầu ra tiêu chuẩn.

--wiki
Viết danh sách các tùy chọn dòng lệnh vào đầu ra tiêu chuẩn trong đánh dấu MediaWiki.

--Đàn ông
Viết nguồn trang người đàn ông trong đánh dấu 'nroff' cho đầu ra tiêu chuẩn.

--phiên bản
Viết phiên bản bộ công cụ ra đầu ra tiêu chuẩn.

--echo
Viết dòng lệnh hiện tại vào đầu ra tiêu chuẩn.

--verbose cấp
Đặt mức độ chi tiết.

--dài dòng, -v
Mức độ chi tiết tăng lên 1 (không dùng nữa; được hỗ trợ cho khả năng tương thích ngược).

--chủ đề
Đặt số lượng luồng song song tối đa (cho luồng POSIX và OpenMP).

Đầu vào Các lựa chọn
--b0count
Số b = 0 ảnh ở đầu danh sách ảnh. Những thứ này không được bao gồm trong
phát hiện phân đoạn xấu hoặc che dấu, nhưng cũng được ghi vào thư mục đầu ra cho
sự tiện lợi. Giả thiết rằng tất cả b = 0 hình ảnh đều ở đầu danh sách
hình ảnh đầu vào, nhưng không phải ở cuối hoặc ở giữa. [Vỡ nợ: 0]

--slice-hướng
Xác định hướng lát cắt của hình ảnh khuếch tán. Các giá trị được hỗ trợ: "axial",
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", trong đó giá trị mặc định là "axial",
hoặc sử dụng một trong các cách sau:

- trục
Lát dọc trục [Cái này is các vỡ nợ]

--dọc
Lát Sagittal

--vòng hoa
Lát vành tai

--lát-x
Trục tọa độ X là hướng lát cắt

--lát-y
Trục tọa độ Y là hướng lát cắt

--lát-z
Trục tọa độ Z là hướng lát cắt [Cái này is các vỡ nợ]

Bad Slice Phát hiện
--stdev
Ngưỡng nhận dạng lát cắt xấu theo đơn vị đo cường độ độ lệch chuẩn trên
tất cả các lát cắt tương ứng từ các hình ảnh khuếch tán còn lại. [Vỡ nợ: 3]

Đầu ra Các lựa chọn
- chuyển đổi sang
Kiểu dữ liệu vô hướng cho hình ảnh đầu ra. Nếu giá trị đệm của bạn là âm nhưng
dữ liệu đầu vào chưa được ký, chẳng hạn, hãy đảm bảo chọn kiểu dữ liệu đã ký cho
đầu ra. Theo mặc định, kiểu dữ liệu đầu ra giống với kiểu đầu vào. Được hỗ trợ
giá trị: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double" hoặc sử dụng
một trong những điều sau đây:

--char
8 bit, có dấu

--byte
8 bit, không dấu

--ngắn
16 bit, có dấu

--nguyên tắc
16 bit, không dấu

--NS
32 bit được ký

- gợi ý
32 bit không dấu

--trôi nổi
32 bit dấu phẩy động

--kép
64 bit dấu phẩy động

--giá trị đệm , -p
Giá trị đệm để thay thế dữ liệu của các lát xấu được phát hiện trong hình ảnh đầu ra. [Vỡ nợ: -1]

--thư mục đầu ra , -o
Đường dẫn hệ thống tệp để ghi hình ảnh với các lát xấu bị che đi (tức là, được lấp đầy bởi
giá trị đệm). [Vỡ nợ: KHÔNG AI]

TÁC GIẢ

Torsten Rohlfing, với sự đóng góp của Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B.Russakoff và Yaroslav Halchenko

Sử dụng cmtk-dwi_mask_bad_slices trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net