Đây là lệnh createChemistryHeader có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
createChemistryHeader.py - Tạo tiêu đề SAM bằng hóa học giải trình tự PacBio
thông tin
MÔ TẢ
cách sử dụng: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
input_alignment_file đầu ra_header_file
createChemistryHeader tạo một tiêu đề SAM chứa thông tin hóa học được sử dụng bởi
Run.
vị trí tranh luận:
đầu vào_alignment_file
Tệp SAM hoặc BAM do BLASR tạo ra.
đầu ra_header_file
Tên của tệp tiêu đề SAM hoặc BAM sẽ được tạo bằng thông tin hóa học
nạp vào.
không bắt buộc tranh luận:
-h, --Cứu giúp
hiển thị thông báo trợ giúp này và thoát
--gỡ lỗi
Xuất thông tin nhật ký chi tiết. (mặc định: Sai)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
Các tệp bas hoặc bax có chứa các lần đọc được căn chỉnh trong
input_alignment_file. Ngoài ra có thể là một fofn của các tệp bas hoặc bax. (mặc định: Không có)
Sử dụng createChemistryHeader trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
