Đây là lệnh fastaq-add_indels có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
fastaq_add_indels - Xóa hoặc chèn các cơ sở tại (các) vị trí nhất định
MÔ TẢ
cách sử dụng: fastaq_add_indels [tùy chọn]
Xóa hoặc chèn các cơ sở tại (các) vị trí nhất định
vị trí tranh luận:
infile Tên của tập tin đầu vào
ô uế
Tên của tệp đầu ra
không bắt buộc tranh luận:
-h, --Cứu giúp
hiển thị thông báo trợ giúp này và thoát
-d Tên: bắt đầu: căn cứ, --xóa bỏ Tên: bắt đầu: căn cứ
Xóa các cơ sở đã cho khỏi dãy đã cho. Định dạng giống như chế độ xem samtools:
tên: đầu-cuối. Tùy chọn này có thể được sử dụng nhiều lần (một lần cho mỗi khu vực để
xóa bỏ). Các coords chồng chéo sẽ được hợp nhất trước khi xóa
--delete_range P, bắt đầu, bước
Xóa các cơ sở bắt đầu từ vị trí P trong mỗi trình tự của tệp đầu vào. Xóa
start + (n-1) * cơ sở bước từ trình tự n.
-i Tên: bắt đầu: căn cứ, --chèn Tên: bắt đầu: căn cứ
Chèn một chuỗi cơ sở ngẫu nhiên tại vị trí đã cho. Định dạng là
name: position: number_to_add. Căn cứ được thêm vào sau vị trí. Tùy chọn này có thể được
sử dụng nhiều lần
--insert_range P, bắt đầu, bước
Chèn các cơ sở ngẫu nhiên bắt đầu sau vị trí P trong mỗi trình tự của tệp đầu vào.
Chèn các cơ sở bắt đầu + (n-1) * bước vào dãy n.
Sử dụng fastaq-add_indels trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
