Đây là lệnh fdnamle có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
fdnaml - Ước tính phát sinh chủng loại nucleotide theo khả năng tối đa
SYNOPSIS
fdnml -sự nối tiếp phần tiếp theo -intreefile cây [-các thể loại số nguyên] -tỷ lệ mảng
-Thể loại tài sản [-trọng lượng tài sản] -điểm mạnh boolean [-tratio phao]
[-tần số từ bật lên] -tần số cơ bản mảng [-gamma ] - hiệu quả phao
-ngammacat số nguyên -hệ số âm thanh phao -ninvarcat số nguyên -invarfrac phao
-nhmmcategories số nguyên -hmrates mảng -mmprobabilities mảng -adjsite boolean
-lambda phao -njumble số nguyên -hạt giống số nguyên -toàn cầu boolean [-outgrno số nguyên]
[-thô boolean] -outfile ô uế [-cá hồi bật lên] -outtreefile ô uế
[-printdata boolean] [-tiến triển boolean] [-dấu chân cây boolean] [-hypstate boolean]
fdnml -Cứu giúp
MÔ TẢ
fdnml là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Phylogeny: Molecular sequin".
LỰA CHỌN
Đầu vào phần
-sự nối tiếp phần tiếp theo
Tệp chứa một hoặc nhiều căn chỉnh theo trình tự
-intreefile cây
-các thể loại số nguyên
Giá trị mặc định: 1
-tỷ lệ mảng
-Thể loại tài sản
-trọng lượng tài sản
Tệp trọng lượng
thêm vào phần
-điểm mạnh boolean
Giá trị mặc định: N
-tratio phao
Giá trị mặc định: 2.0
-tần số từ bật lên
Giá trị mặc định: Y
-tần số cơ bản mảng
Giá trị mặc định: 0.25 0.25 0.25 0.25
-gamma
Giá trị mặc định: Tỷ lệ không đổi
- hiệu quả phao
Giá trị mặc định: 1
-ngammacat số nguyên
Giá trị mặc định: 1
-hệ số âm thanh phao
Giá trị mặc định: 1
-ninvarcat số nguyên
Giá trị mặc định: 1
-invarfrac phao
Giá trị mặc định: 0.0
-nhmmcategories số nguyên
Giá trị mặc định: 1
-hmrates mảng
Giá trị mặc định: 1.0
-mmprobabilities mảng
Giá trị mặc định: 1.0
-adjsite boolean
Giá trị mặc định: N
-lambda phao
Giá trị mặc định: 1.0
-njumble số nguyên
-hạt giống số nguyên
Giá trị mặc định: 1
-toàn cầu boolean
Giá trị mặc định: N
-outgrno số nguyên
-thô boolean
Giá trị mặc định: Y
Đầu ra phần
-outfile ô uế
-cá hồi bật lên
Giá trị mặc định: Y
-outtreefile ô uế
-printdata boolean
Giá trị mặc định: N
-tiến triển boolean
Giá trị mặc định: Y
-dấu chân cây boolean
Giá trị mặc định: Y
-hypstate boolean
Giá trị mặc định: N
Sử dụng fdnamle trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
