Tiếng AnhTiếng PhápTiếng Tây Ban Nha

Chạy máy chủ | Ubuntu > | Fedora > |


Biểu tượng yêu thích OnWorks

fuzztrane - Trực tuyến trên đám mây

Chạy fuzztrane trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks trên Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS

Đây là lệnh fuzztrane có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN


fuzztran - Tìm kiếm các mẫu trong trình tự protein (đã dịch)

SYNOPSIS


fuzztran -sự nối tiếp seqall -mẫu Belt Hold [-khung ] [-bàn ] -outfile báo cáo

fuzztran -Cứu giúp

MÔ TẢ


fuzztran là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Nucleic: Motifs, Protein: Motifs".

LỰA CHỌN


Đầu vào phần
-sự nối tiếp seqall

-mẫu Belt Hold
Các mã một chữ cái IUPAC tiêu chuẩn cho các axit amin được sử dụng. Ký hiệu 'x' là
được sử dụng cho một vị trí mà bất kỳ axit amin nào được chấp nhận. Sự mơ hồ được chỉ ra bởi
liệt kê các axit amin được chấp nhận cho một vị trí nhất định, giữa các dấu ngoặc vuông '[
] '. Ví dụ: [ALT] là viết tắt của Ala hoặc Leu hoặc Thr. Sự mơ hồ cũng được chỉ ra bởi
liệt kê giữa một cặp dấu ngoặc nhọn '{}' các axit amin không được chấp nhận
ở vị trí gven. Ví dụ: {AM} là viết tắt của bất kỳ axit amin nào ngoại trừ Ala và Met.
Mỗi phần tử trong một mẫu được phân tách với phần tử lân cận của nó bằng dấu '-'. (Tùy chọn trong
fuzztran) Sự lặp lại của một phần tử của mẫu có thể được chỉ ra bằng cách sau
phần tử có một giá trị số hoặc một phạm vi số giữa dấu ngoặc đơn. Ví dụ:
x(3) tương ứng với xxx, x (2,4) tương ứng với xx hoặc xxx hoặc xxxx. Khi một
mẫu được giới hạn đối với đầu cuối N hoặc C của một chuỗi, mẫu đó
hoặc bắt đầu bằng ký hiệu '<' hoặc tương ứng kết thúc bằng ký hiệu '>'. Một giai đoạn kết thúc
mô hình. (Tùy chọn trong fuzztran). Ví dụ: [DE] (2) HS {P}X(2) PX (2,4) C

thêm vào phần
-khung
Giá trị mặc định: 1

-bàn

Đầu ra phần
-outfile báo cáo

Sử dụng fuzztrane trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net


Ad


Ad