Đây là lệnh gt-eval có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
gt-eval - So sánh các tệp chú thích và hiển thị các thước đo độ chính xác (dự đoán so với tham chiếu).
SYNOPSIS
gt đánh giá tham chiếu_tệp dự đoán_tệp
MÔ TẢ
-núc [có | không]
đánh giá mức nucleotide (mức tiêu thụ bộ nhớ tỷ lệ thuận với kích thước tệp đầu vào)
(mặc định: có)
-ltr [có | không]
đánh giá dự đoán LTR retrotransposon thay vì dự đoán gen (tất cả
Các phần tử LTR_retrotransposon được coi là có một chuỗi không xác định) (mặc định:
không)
-ltdelta [giá trị]
đặt delta được phép để các đường viền LTR được coi là bằng nhau (mặc định: 20)
-v [có | không]
dài dòng (mặc định: không)
-o [tên tập tin]
chuyển hướng đầu ra đến tệp được chỉ định (mặc định: không xác định)
-gzip [có | không]
ghi tệp đầu ra nén gzip (mặc định: không)
-bzip2 [có | không]
ghi tệp đầu ra nén bzip2 (mặc định: không)
-lực lượng [có | không]
buộc ghi vào tệp đầu ra (mặc định: không)
-Cứu giúp
hiển thị trợ giúp và thoát
-phiên bản
thông tin phiên bản màn hình và thoát
Chương trình hiển thị các giá trị độ nhạy và độ đặc hiệu cho các loại tính năng nhất định (ví dụ:
gen, mRNA và exon). Đối với một số loại tính năng, số lượng tính năng bị thiếu và sai của
loại đó cũng được hiển thị. Do đó, "thiếu" có nghĩa là số lượng tính năng của loại đó từ
"tham chiếu" mà không trùng lặp với một đối tượng địa lý thuộc loại đó từ "dự đoán". Hành vi xấu xa
ngược lại, "sai" biểu thị số lượng tính năng của loại đó từ "dự đoán" mà không có
trùng lặp với một đối tượng của loại đó từ "tham chiếu".
BÁO CÁO GIỎI
Báo cáo lỗi cho[email được bảo vệ]>.
Sử dụng gt-eval trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
