Đây là lệnh gt-gff3validator có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
gt-gff3validator - Xác thực nghiêm ngặt các tệp GFF3 đã cho.
SYNOPSIS
gt trình xác thực gff3 [tùy chọn ...] [GFF3_file ...]
MÔ TẢ
-đánh máy [chuỗi]
sử dụng bản thể luận được cung cấp trong tệp OBO để xác thực mối quan hệ cha-con. Nếu không
được đưa ra, tệp sofa.obo từ thư mục gtdata / obo_files được sử dụng. Nếu như
một đối số được đưa ra, nó được sử dụng làm tên tệp OBO. Trong trường hợp một tệp như vậy
không tồn tại .obo được thêm vào đối số và tải tên tệp kết quả từ
thư mục gtdata / obo_files đã được thử. (mặc định: không xác định)
-xrfkiểm tra [chuỗi]
kiểm tra các thuộc tính Dbxref và Ontology_term để biết cú pháp chính xác theo
tập tin định nghĩa viết tắt. Nếu không có đối số nào được đưa ra, tệp GO.xrf_abbs từ
thư mục gtdata / xrf_abbr được sử dụng. Nếu một đối số được đưa ra, nó được sử dụng như một
tên tệp cho một tệp viết tắt. Trong trường hợp tệp như vậy không tồn tại,
.xrf_abbr được thêm vào đối số và tải tên tệp kết quả từ
thư mục gtdata / xrf_abbr đã được thử. (mặc định: không xác định)
-Cứu giúp
hiển thị trợ giúp và thoát
-phiên bản
thông tin phiên bản màn hình và thoát
BÁO CÁO GIỎI
Báo cáo lỗi cho[email được bảo vệ]>.
Sử dụng gt-gff3validator trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
