gt-repfind - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

gt-repfind - Tính toán các kết quả phù hợp chính xác tối đa (và hơn thế nữa).

SYNOPSIS

gt trả lại [tùy chọn] -ii tên chỉ mục

MÔ TẢ

-l [giá trị]
Chỉ định độ dài tối thiểu của các kết quả phù hợp (mặc định: 0)

-f [có | không]
Tính toán các kết quả phù hợp chuyển tiếp (mặc định: có)

-r [có | không]
Tính toán các kết quả so khớp ngược (mặc định: không)

-p [có | không]
Tính toán các kết quả phù hợp trên chuỗi đảo ngược (mặc định: không)

-chiều dài hạt giống [giá trị]
Chỉ định độ dài tối thiểu của hạt giống (mặc định: 0)

-tần số tối đa [giá trị]
Chỉ định tần suất tối đa của các đối sánh chính xác tối đa trong chuỗi tham chiếu (mặc định: 0)

-extendxdrop [giá trị]
Mở rộng hạt giống sang cả hai bên bằng cách sử dụng thuật toán xdrop, chỉ định tham số tùy chọn
độ nhạy (mặc định: 97)

-xdropbên dưới [giá trị]
Chỉ định điểm cắt xdrop (đối số 0 có nghĩa là không xác định). Nếu không được xác định, một giá trị tối ưu
được xác định tự động tùy thuộc vào tỷ lệ lỗi

-mở rộng tham lam [giá trị]
Mở rộng hạt giống sang cả hai bên bằng cách sử dụng thuật toán tham lam với việc cắt tỉa các sóng, tùy chọn
tham số chỉ định độ nhạy (mặc định: 97)

-tân tính [giá trị]
Chỉ định danh tính tối thiểu của các kết quả phù hợp dưới dạng số nguyên trong phạm vi từ 70 đến 99 (đối với xdrop
và tiện ích mở rộng tham lam) (mặc định: 80)

-a [giá trị]
hiển thị căn chỉnh / trình tự để đối sánh chính xác (đối số tùy chọn là số cột
mỗi dòng) (mặc định: 70)

-ii [chuỗi]
Chỉ định chỉ mục đầu vào (mặc định: không xác định)

-quét [có | không]
quét chỉ mục thay vì ánh xạ nó vào bộ nhớ chính (mặc định: không)

-v [có | không]
dài dòng (mặc định: không)

-Cứu giúp
hiển thị trợ giúp và thoát

-phiên bản
thông tin phiên bản màn hình và thoát

BÁO CÁO GIỎI

Báo cáo lỗi cho[email được bảo vệ]>.

Sử dụng gt-repfind trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net