Đây là lệnh loadPulses có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
loadPulses - tải thông tin xung tuần tự tải
SYNOPSIS
tảiXung tên tập tin cơ bản cmpTên tệp [lựa chọn]
MÔ TẢ
tảiXung tải thông tin xung tuần tự như khoảng cách hoặc chất lượng giữa các xung
thông tin vào tệp cmp.h5. Điều này cho phép người ta phân tích động học và chất lượng
thông tin theo cột căn chỉnh.
LỰA CHỌN
tên tập tin cơ bản
Đầu vào {bas, pls} .h5 hoặc input.fofn.
cmpTên tệp
Tệp cmp.h5 để tải thông tin xung vào.
-đo lường giá trị
Danh sách chỉ số được phân tách bằng dấu phẩy (không có dấu cách).
Các tùy chọn hợp lệ là:
Khi bắt đầu, Giá trị chất lượng, InsertionQV, MergeQV, DeletionQV, DeletionTag,
ReplaceTag, SubstitutionQV, PreBaseFrames, IPD, StartFrame, PulseWidth,
WidthInFrames, Light, pkmid, ClassifierQV, Pulse Index
Các tùy chọn mặc định là:
QualityValue, ClassifierQV, StartFrame, PulseWidth, widthInFrames, pkmid,
IPD
-failOnMissingData
Thoát nếu bất kỳ trường dữ liệu nào bị thiếu từ đầu vào bas.h5 hoặc pls.h5 được
cần thiết để tải một số liệu. Defualt là một cảnh báo.
-bộ nhớ
Tải thông tin xung bằng cách đọc thay vì chỉ số vào bộ đệm.
-bymetric
Tải thông tin xung theo số liệu thay vì đọc. Điều này sử dụng nhiều bộ nhớ hơn
-bộ nhớ, nhưng có thể nhanh hơn.
-maxElements giá trị
Đặt giới hạn về kích thước của tệp pls / bas để đệm vào -bymetric (giá trị mặc định:
số nguyên tối đa). Sử dụng -bộ nhớ nếu vượt quá giới hạn.
-maxMemory giá trị
Đặt giới hạn (tính bằng GB) trên bộ nhớ để đệm dữ liệu với -bymetric (giá trị mặc định: 4
GB). Sử dụng -bộ nhớ nếu vượt quá giới hạn.
-metaNEelements giá trị
Đặt số phần tử trong bộ đệm ẩn dữ liệu meta để đọc tệp bas / bax / pls.h5.
-rawNEElementsgiá trị
Đặt số phần tử trong bộ đệm dữ liệu thô để đọc tệp bas / bax / pls.h5.
-rawChunkSize giá trị
Đặt kích thước chunk của bộ đệm dữ liệu thô để đọc tệp bas / bax / pls.h5.
Sử dụng loadPulses trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net