Đây là lệnh ltrsift có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
ltrsift - một giao diện đồ họa để xử lý sau xử lý và phân loại LTR
ứng cử viên retrotransposon
SYNOPSIS
rây
MÔ TẢ
LTRsift là một công cụ đồ họa trên máy tính để bàn bán tự động xử lý sau de novo được dự đoán
LTR dịch lại các chú thích, chẳng hạn như chú thích được tạo bởi LTRharvest và LTRdigest.
CẤU HÌNH
Các mã nhị phân CUỐI CÙNG (lastal và lastdb) phải được đặt trong đường dẫn tìm kiếm hệ thống. Nếu họ
không, liệu có thể chỉ định vị trí của họ bằng cách sử dụng môi trường “GT_LAST_PATH" không
trước khi chạy LTRsift. Điều tương tự cũng áp dụng cho vị trí BLAST. Sử dụng
`` GT_BLAST_PATH "để chỉ định đường dẫn đầy đủ đến tệp thực thi" blastall ".
Tệp định kiểu (mô tả sơ đồ tuyến tính của các đối tượng địa lý ứng viên trông như thế nào) có thể
được đặt thông qua biến môi trường LTRSIFT_STYLE_FILE. Một phong cách mặc định hợp lý được xây dựng
vào LTRsift.
Sử dụng ltrsift trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
