Đây là lệnh newicktotxt có thể được chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
njplot - Một chương trình vẽ cây phát sinh loài cho các nhà sinh vật học mới - vẽ phát sinh loài
cây vào tệp PostScript
SYNOPSIS
njplot [lựa chọn] tập tin cây
newicktop [lựa chọn] tập tin cây
newicktotxt [lựa chọn] tập tin cây
MÔ TẢ
Trang hướng dẫn sử dụng này tài liệu ngắn gọn về njplot chỉ huy.
newicktop lệnh thực hiện chính xác như vậy nhưng không cần hiển thị X11. Đầu ra là
được kết xuất thành một tệp PostScript.
newicktotxt lệnh thực hiện giống hệt như newicktop nhưng đầu ra được kết xuất
thành một tệp văn bản.
Trang hướng dẫn này được viết lại cho bản phân phối Debian GNU / Linux vì bản gốc
chương trình không có trang hướng dẫn sử dụng.
njplot là một chương trình vẽ cây có thể vẽ bất kỳ cây nhị phân hoặc nhiều nhánh nào được thể hiện
ở định dạng cây phát sinh loài tiêu chuẩn (ví dụ: định dạng được gói PHYLIP sử dụng).
NJplot đặc biệt thuận tiện cho việc root các cây chưa được root lấy từ parsimony,
khoảng cách hoặc các phương pháp xây dựng cây có khả năng xảy ra tối đa.
Bất kỳ quá trình root nào của cây chưa được root đều có thể được chỉ định một cách tương tác bằng cách sử dụng chuột. NJplot
cũng cho phép phóng to, hoán đổi nhánh, hiển thị điểm số bootstrap và lưu trong
Định dạng PostScript. NJplot do đó có thể được sử dụng như một phần mở rộng đồ họa của bất kỳ gói nào
của chương trình phát sinh loài sử dụng định dạng cây tiêu chuẩn để lưu trữ cây (ví dụ:
với hầu hết các gói như vậy).
LỰA CHỌN
Chỉ có các tùy chọn sau chỉ hoạt động trong trình giả lập x-terminal, nhưng không hoạt động trong
chế độ giao diện điều khiển:
-h In ra sự trợ giúp ngắn gọn.
-chúng ta Tệp cây tái bút chuẩn bị cho khổ giấy US Letter.
-chỉ
Không có giao diện cửa sổ, chỉ cần ghi tệp cây PostScript.
-kích thước n
Kích thước phông chữ n được sử dụng cho tên đơn vị phân loại.
-pc n số trang cho đầu ra PostScript.
-psize chiều rộng x chiều cao
kích thước của trang PostScript được biểu thị bằng WIDTHxHEIGHT.
-điểm mạnh
Hiển thị độ dài nhánh nếu chúng xuất hiện trong tệp dạng cây.
-khởi động Hiển thị các giá trị bootstrap nếu chúng xuất hiện trong tệp dạng cây.
-Không tiêu đề
Không bao gồm tiêu đề trong đầu ra PostScript.
Sử dụng newicktotxt trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
