Đây là lệnh rdp-alignment có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
rdp-alignment: - Gói công cụ căn chỉnh Ribosomal Database Project (RDP)
SYNOPSIS
căn chỉnh rdp
MÔ TẢ
Gói công cụ Căn chỉnh chứa các lệnh để thực hiện phân tích cộng đồng đã xác định, theo từng cặp
căn chỉnh và mô hình markov ẩn (mô hình HMMER3, không có đào tạo).
LỰA CHỌN
Danh sách của lệnh con:
sự liên kết-sáp nhập
- Hợp nhất các liên kết
theo cặp-knn
- Tính k-láng giềng gần nhất bằng cách căn chỉnh theo cặp
so sánh-loại-lỗi
- Phát hiện các lỗi chèn, xóa và thay thế trong các chuỗi so với
trình tự tham chiếu
căn chỉnh-nucl-to-prot
- Chuyển sự sắp xếp trình tự từ trình tự prôtêin sang trình tự nuclêôtit
rm-partseq
- loại bỏ các trình tự từng phần dựa trên sự liên kết theo cặp với các trình tự tham chiếu
Sử dụng rdp-alignment trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
