Đây là ứng dụng Linux có tên CaptureProbe có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng Runningexample.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên CaptureProbe với OnWorks này miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
chụp thăm dò
Ad
MÔ TẢ
Tại đây, chúng tôi đã phát triển CaptureProbe, một công cụ Java đồ họa và thân thiện với người dùng để thiết kế các đầu dò chụp cho các ứng dụng Capture Hi-C. CaptureProbe dễ sử dụng, chỉ cần các tệp đầu vào đơn giản và cung cấp các thông số phong phú để thiết kế đầu dò. CaptureProbe có thể thiết kế các đầu dò đặc biệt cho cả các vị trí bộ gen và các vùng gen quan tâm. So sánh với các phần mềm hiện có (HiCapTools và GOPHER) chỉ ra rằng CaptureProbe có tỷ lệ thiết kế thành công tốt và độ đặc hiệu của đầu dò tốt hơn.
Trích dẫn: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: một công cụ java để thiết kế đầu dò cho các ứng dụng chụp ảnh Hi-C. Zool Res [J], 41: 94-96.
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
