Đây là ứng dụng Linux có tên CStone có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng cstone.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên CStone này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
Cstone
MÔ TẢ
CStone là trình hợp dịch de novo cho dữ liệu RNA-Seq sử dụng de Bruijn giống như các biểu đồ và chú thích từng đường nét được tạo ra với một trong ba mức phân loại đồ thị cho biết liệu nó có thể được đảm bảo là không phải là chimeric hay không. Mức độ phân loại phụ thuộc vào độ phức tạp của họ gen mà từ đó các số đọc được bắt nguồn. Như một sản phẩm phụ, điều này cũng cung cấp cái nhìn sâu sắc về cấu trúc cấu trúc của các họ gen cơ bản đã được giải trình tự. Các chi tiết khác sẽ sớm có trong bài báo của chúng tôi: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
Tính năng
- De novo lắp ráp dữ liệu RNA-Seq.
- Xác định các đường nét không phải là chimeric.
- Khả năng tương thích đa nền tảng.
- Có sẵn lọ thực thi.
- Không cần gói bên ngoài.
- Mã dễ làm theo và được kết hợp với các công cụ khác.
- Thông tin về độ phức tạp của các họ gen cơ bản.
- de Bruijn thích cách tiếp cận (khoan dung hơn).
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/cstone/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
