Đây là ứng dụng Linux có tên MANTI.pl / muda.pl để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng muda.pl-v3.6.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên MANTI.pl / muda.pl để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
MANTI.pl / muda.pl để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
-------- CHÚ Ý BẮT ĐẦU: RENAMINGmuda.pl đã được đổi tên thành MANTI.pl với v3.7, việc phát triển dự án có thể được theo dõi trên trang dự án MANTI trên nguồnforge.net. Các phiên bản cũ vẫn ở đây cho mục đích lưu trữ.
-------- CHÚ Ý KẾT THÚC
muda.pl là một tập lệnh đánh giá (được viết bằng Perl) không có sự phụ thuộc lớn.
Nó tổng hợp thông tin từ 4 tệp đầu ra MaxQuant khác nhau thành một tệp chính phù hợp một cách rõ ràng cho các phân tích protein neo-termini. Mỏ neo trung tâm cho tập hợp dữ liệu là tệp modificationSpecificPeptides.txt - dữ liệu bổ sung được suy ra từ các tệp nguồn khác từ thư mục txt MaxQuant nhưng điểm bắt đầu của cụm dữ liệu chỉ là tệp modificationSpecificPeptides.txt. Có thể cũng hữu ích cho các mục đích proteomics bình thường nhưng tập lệnh này được tối ưu hóa rất nhiều cho việc xác định và xác nhận protein neo-termini.
Để được giải thích cặn kẽ hơn về các thông số tập lệnh và chiến lược đánh giá, vui lòng tham khảo PDF hướng dẫn mở rộng.
Tính năng
- Đánh giá dữ liệu MaxQuant
- Xác nhận và xác nhận Protein-Termini
- Chú thích và lắp ráp dữ liệu UniProt
- Ánh xạ lại các Termini đã được xác định thành Isoforms
- Tích hợp Limma, LOCALIZER & TopFINDer
- Được ghi chép rõ ràng
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/muda/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
