Đây là ứng dụng Linux có tên MetaPhat -meta-pheno-Association-tracker có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng meta_phat.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên MetaPhat -meta-pheno-Association-tracker với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
MetaPhat -meta-pheno-Association-tracker
MÔ TẢ
MetaPhat là một công cụ hoạt động và có nguồn mở (giấy phép MIT) để phát hiện các biến thể có liên kết đa biến bằng cách sử dụng thống kê tóm tắt từ các nghiên cứu GWAS đơn biến. Ứng dụng cũng thực hiện phân rã bằng cách tìm các tập con BIC tối ưu và các đặc điểm trình điều khiển giá trị P cho các biến thể dẫn đa biến. Các kết quả khác nhau được truy tìm và tập hợp lại để hỗ trợ việc phân tích các mối quan hệ kiểu hình-kiểu gen.Vui lòng xem trang chủ wiki của chúng tôi để biết hướng dẫn cài đặt, định dạng dữ liệu GWAS bắt buộc và đầu vào mẫu với lệnh kiểm tra - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Dữ liệu về lipid toàn cầu (GLGC, Willer 2013) dữ liệu / ví dụ về tar nguồn - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Nếu bạn gặp sự cố hoặc có yêu cầu tính năng sau khi thử ví dụ và đọc hướng dẫn, vui lòng gửi email: [email được bảo vệ]
Bản quyền <2019> [email được bảo vệ], [email được bảo vệ]
Tính năng
- phân tích tính trạng trên toàn bộ gen đa biến
- p-value và lựa chọn tập hợp con tính trạng tối ưu dựa trên BIC
- đặc điểm dấu vết phân hủy
- dẫn SNP và tệp tóm tắt đặc điểm trình điều khiển
- snp-snp đặc điểm cấp bậc nhóm giáo
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
