Đây là ứng dụng Linux có tên PARSEC - PAtteRn SEarch / Context có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng PARSEC_Deployment_Package_v2.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên PARSEC - PAtteRn SEarch / Context with OnWorks này miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
PARSEC - PAtteRn SEarch / Ngữ cảnh
MÔ TẢ
Việc xác định đặc điểm của các vị trí bộ gen là một thách thức lớn trong việc hiểu và khai thác dữ liệu giải trình tự thế hệ tiếp theo. Hầu hết các vị trí bộ gen được thể hiện bằng các mô típ ngắn, thoái hóa, phân bố rải rác và đôi khi có chức năng sinh học (ví dụ: điều hòa biểu hiện gen, kiểu nối hoặc tín hiệu biểu sinh). Những mô hình này có liên quan đến một lượng lớn tiếng ồn và do đó, sự phát triển của một nền tảng tính toán để phát hiện chính xác các vị trí bộ gen đòi hỏi phải tích hợp nhiều dữ liệu sinh học quy mô lớn khác nhau để lọc ra các kết quả dương tính giả.
PARSEC đại diện cho một giải pháp trực quan, mô-đun (dễ dàng mở rộng) và tất cả trong một để tích hợp hiệu quả nhiều thông tin bộ gen đa dạng nhằm thực hiện bản địa hóa phi tuyến tính và mô tả đặc điểm của các vị trí sinh học trong một môi trường thân thiện với người dùng.
Xem wiki để biết các yêu cầu phần cứng và các trình duyệt được hỗ trợ.
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dựa trên web
Ngôn ngữ lập trình
C ++, Java
Môi trường cơ sở dữ liệu
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pssql)
Categories
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
