Đây là ứng dụng Linux có tên PPSeq: Phân tích NGS song song để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng này có tên PPSeq: Phân tích NGS song song để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
PPSeq: Phân tích NGS song song để chạy trong Linux trực tuyến
MÔ TẢ
Công nghệ giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) thông lượng cao đã nhanh chóng nổi lên như một công cụ mạnh mẽ trong nhiều khía cạnh của nghiên cứu y sinh. Tuy nhiên, cùng với sự phát triển nhanh chóng của nó, cường độ dữ liệu và độ phức tạp phân tích cho NGS vượt xa khả năng và khả năng của các phương tiện tính toán quy mô nhỏ truyền thống, chẳng hạn như các thuật toán đa luồng trên các máy trạm độc lập. Để giải quyết vấn đề này, ở đây chúng tôi trình bày một giải pháp sử dụng nguồn cung cấp năng lượng xử lý ngày càng tăng của các hệ thống xử lý song song (MPP) lớn.Tính năng
- ppalgn - sắp xếp các lần đọc trình tự thành chuỗi tham chiếu dài
- ppbwt - xây dựng chỉ số FM từ một tập hợp các trình tự DNA
Khán giả
Giáo dục, Kỹ thuật, Ngành chăm sóc sức khỏe, Công nghệ thông tin, Tổ chức phi lợi nhuận, Khoa học / Nghiên cứu
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
C + +
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/ppseq/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
