这是 zalign 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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zalign - 生物序列的并行局部比对
概要
对齐 [-s 分数] [-S 拆分] [-H hblk] [-V vblk] file1 file2
商品描述
zAlign 是一种局部序列比对器，特别适用于大型生物 DNA
序列，超过 1Mbp（百万碱基对）。 它使用 Smith-Waterman 精确
具有仿射间隙成本函数的算法来执行此任务。
一般用途总体评估 opţiuni:
-h 显示此帮助并退出
-s
指定在计算对齐时使用的逗号分隔的分数列表
整个程序中的矩阵。 该列表必须采用以下格式
“-sMATCH,MISMATCH,GAP_OPEN,GAP_EXTENSION”（不带引号），并在此解析
精确的顺序； 值之间不允许有空格。 如有不明之处
参数，这些设置为默认值并发出警告消息；
超出的参数被丢弃
阶段 2 opţiuni:
-S
（仅 mpialign）分割对齐矩阵的部分数量； 在这之后
step 应用循环块模型，将每个部分均等地细分为所有
可用节点
-H
（仅 mpialign）每个节点对其进行的水平细分数
对齐子矩阵； 因为这个值定义了块宽度，一个好的选择应该是
允许两个完整的矩阵行来适应处理器的缓存页面，改进算法
性能
-V
（仅 mpialign）每个节点对其对齐进行的垂直细分数
子矩阵； 该值直接影响节点间通信量，是
仅在 'split' 设置为 1 时使用，否则设置为可用的数量
节点
使用 onworks.net 服务在线使用 zalign
