UniPyRange 在 Linux 中运行 在线下载 Linux 版

这是名为 UniPyRange 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可作为 UniPyRangeSuite.py 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

 
 

下载并在线运行这个名为 UniPyRange 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

截图:


UniPyRange 在 Linux 中在线运行


描述:

非常简单的 python 脚本,它使您无需在 Uniprot 和 NCBI RefSeq 数据库 (1, 2) 的 fasta 文件中计算氨基酸/DNA 碱基。
假设您想要 128 个氨基酸蛋白质中 387-1000 范围内的氨基酸序列 - 该脚本将帮助您避免计数错误,只需向您显示氨基酸和编码 DNA 碱基对中的指定序列(非常适合扩增引物设计) ) 的指定 Uniprot ID。

- 需要 BioPython (3) 和 Bioservices Package (4)


(1)
UniProt 联盟
UniProt:蛋白质信息中心
核酸研究。 43:D204-D212(2015)。
(2)
RefSeq:哺乳动物参考序列的更新。 核酸研究。 2014 年 1 月 42 日;1(756):D63-XNUMX。
(3)
公鸡 PJ 等。 生物信息学 (2009)
(4)
Cokelaer 等人,生物信息学 (2013)

程式语言

蟒蛇



这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/unipyrange/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。



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