这是命令 bed2gff3p 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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ucsc_genes2gff.pl - 将 UCSC 基因组浏览器格式的基因文件转换为适合的 GFF 文件
用于加载到 gbrowse
概要
% uscsc_genes2gff.pl [选项] ucsc_file1 ucsc_file2...
选项：
-src 选择基因来源，默认“UCSC”
-起源选择与编号的相对位置，默认
是“1”
商品描述
此脚本处理可从 UCSC 基因组的“表格”链接获得的基因文件
浏览器 (genome.ucsc.edu) 转换成适合加载 gbrowse 的形式。 警告：它只是
与基因表一起使用。 其他表格，例如 EST 对齐、轮廓和重复，
有自己的格式，需要其他脚本来解析。
要使用此脚本，请从网站上的“表格”链接获取一个或多个 UCSC 表格
浏览器，或来自 UCSC Genome Browser FTP 站点。 将表文件作为参数提供给
这个脚本。 您可能希望提供一个替代的“来源”字段。 否则这
脚本默认为“UCSC”。
% pucsc_genes2gff.pl -src RefSeq refseq_data.ucsc > refseq.gff
然后可以使用以下命令将生成的 GFF 文件加载到 Bio::DB::GFF 数据库中
命令：
%bulk_load_gff.pl -d 参考文献
使用 onworks.net 服务在线使用 bed2gff3p
