这是 bowtie-inspect 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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bowtie-inspect - 从领结索引中提取信息
概要
领结检查 [选项]*
商品描述
ebwt 文件名减去尾随 .1.ebwt/.2.ebwt
默认情况下,将索引核苷酸序列的 FASTA 记录打印为标准
出去。 和 -n, 只打印名称。 和 -s, 只打印索引的摘要
参数和序列。 和 -e, 保留颜色(如果适用)。
配置
--大索引
强制检查“大”索引,即使存在“小”索引。
-a/ - 穿过
FASTA 输出中的字符数(默认值:60)
-n/--名称
仅打印参考序列名称
-s/ - 概括
打印摘要包括ref 名称、长度、索引属性
-e/--ebwt-ref
从 ebwt 重建参考(慢,保留颜色)
-v/--详细
详细输出(用于调试)
-h/ - 帮助
打印工具及其选项的详细说明
- 帮帮我 打印此使用消息
64 位构建于 lgw01-11 Thu Nov 26 11:13:31 UTC 2015 编译器:gcc 版本 5.2.1 20151123
(Ubuntu 5.2.1-25ubuntu1) 选项: -氧气 -Wl,--hash-style=两者 -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -氧气
-fstack-protector-强 -格式 -错误=格式安全 -g -氧气 -fstack-protector-强
-格式 -错误=格式安全 -Wl,-B符号函数 -Wl,-z,relro Sizeof {int, long,
长长,无效*,size_t,off_t}:{4}
使用 onworks.net 服务在线使用 bowtie-inspect