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bp_local_taxonomydb_query - 查询本地 TaxonomyDB 的物种或类群

商品描述

此脚本提供了访问本地分类法数据库的示例实现
用 Berkeley DB 实现（需要 DB_File 模块）。

用法：

bp_local_taxonomydb_query.PLS: [-v] --nodes nodes.dmp --names names.dmp "Genus1 species1" "Genus2 species2"

从 NCBI 分类转储中提供 nodes.dmp 和 names.dmp 文件（请参阅
Bio::DB::Taxonomy::flatfile 了解更多信息）仅在第一次运行时才需要。
这将创建本地索引并且可能需要相当长的时间。 然而一旦创建，
这些索引将允许物种快速访问分类群 ID 或分类群 ID 到物种名称
查找。

使用 onworks.net 服务在线使用 bp_local_taxonomydb_queryp