这是 bp_revtrans-motifp 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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bp_revtrans-motif - 反向翻译类似 Profam 的蛋白质基序
VERSION
版本 0.01
概要
从一个文件：
bp_revtrans-motif.pl -imotifs.txt
使用管道：
bp_revtrans-motif.pl <motifs.txt> output.txt
在命令提示符下交互使用：
$ bp_revtrans-motif.pl
马艾尔[VIKP]
1.ATGGCNGCNGARGARYTNVHN
[^P]H(IW){2,3}
2.NDNCAY（ATHTGG）{2,3}
商品描述
该脚本将蛋白质基序作为输入并返回简并寡核苷酸
对应的顺序。 这样做的主要原因是设计退化
扩增给定序列模式的引物。
输入模体由一串单字母残基组成，具有以下任何一个
句法元素：
[...] : 冗余位置。
允许有多个残基的位置。 例子：
[TS]YW[RKSD]
^^^^^^
[^...] : 否定位置。
允许任何残留的位置，保留用于括号之间的位置。 例子：
[^PW]MK[洛杉矶]
^^
(...){n,m,...} : 重复的主题。
重复的主题 n or m 次。 它可以有任何以前的句法
元素。 例子：
A[SN]C(TXX){2,4,8}
^^^
允许的字母是与 20 种天然氨基酸相对应的字母，加上：
B=N+D
Z = Q + E
X = 全部
配置
-i 输入文件：
包含要反向翻译的主题列表的文件。
-h
显示此帮助消息。
使用 onworks.net 服务在线使用 bp_revtrans-motifp
