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checktranse - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 checktranse

这是命令 checktranse,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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checktrans - 报告蛋白质的终止密码子和 ORF 统计信息

概要


支票交易 -序列 后继 -orfml 整数 [-addlast 布尔] -输出文件 输出文件
-outseq 后序器 -击败 壮举

支票交易 -救命

商品描述


支票交易 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“Nucleic:Gene found,Nucleic:Translation”命令的一部分
组。

配置


输入 部分
-序列 后继

其他要求 部分
-orfml 整数
默认值:100

额外 部分
-addlast 布尔
蛋白质序列中的星号表示终止密码子的位置。 支票交易
假设所有 ORF 都以终止密码子结尾。 强制序列以
星号,如果那里没有,则使 checktrans 将结尾视为
潜在的 ORF。 如果添加星号,则不包括在报告的计数中
停止。 默认值:是

输出 部分
-输出文件 输出文件

-outseq 后序器
用于保存输出 ORF 序列的序列文件

-击败 壮举
输出特征文件

使用 onworks.net 服务在线使用 checktranse


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