cmtk-dwi_mask_bad_slices - 云端在线

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dwi_mask_bad_slices - 在扩散加权图像集中查找坏切片。

概要

dwi_mask_bad_slices 扩散图像路径

商品描述

该工具读取一组 3D 扩散加权 MR 图像并找到不良切片。糟糕的切片
扩散图像中的图像被检测为平均强度超出指定值的图像
剩余部分的所有相应切片的均值周围的间隔
扩散图像。

配置

全球 工具包 附加选项 （这些 ，那恭喜你， 共用的， by 所有 CMTK 工具）
- 帮帮我
将基本命令行选项列表写入标准输出。

--全部帮助
将基本和高级命令行选项的完整列表写入标准输出。

--维基
将命令行选项列表写入 MediaWiki 标记中的标准输出。

- 男人
将“nroff”标记中的手册页源代码写入标准输出。

- 版
将工具包版本写入标准输出。

- 回声
将当前命令行写入标准输出。

--详细级别
设置详细级别。

--详细, -v
将详细级别增加 1（已弃用；支持向后兼容）。

--线程
设置最大并行线程数（对于 POSIX 线程和 OpenMP）。

输入 附加选项
--b0计数
图像列表开头的 b=0 图像的数量。这些不包含在
坏切片检测或屏蔽，但也被写入输出目录
方便。假设所有 b=0 图像都位于列表的开头
输入图像，但不在末尾或中间。 [默认： 0]

--切片方向
定义扩散图像的切片方向。 支持的值：“轴向”，
“矢状”、“冠状”、“切片-x”、“切片-y”、“切片-z”，其中默认为“轴向”，
或使用以下方法之一：

--轴向
轴向切片 [这个 is 此 默认]

--矢状面
矢状切片

- 冠
冠状切片

--切片-x
X坐标轴为切片方向

--切片-y
Y坐标轴为切片方向

--切片-z
Z坐标轴为切片方向 [这个 is 此 默认]

坏 切片 检测
--stdev
以强度标准偏差为单位的坏切片识别阈值
来自剩余扩散图像的所有相应切片。 [默认： 3]

输出 附加选项
- 转换成
输出图像的标量数据类型。如果你的填充值为负但是你的
例如，输入数据无符号，请确保选择有符号数据类型
输出。默认情况下，输出数据类型与输入类型相同。支持的
值：“char”、“byte”、“short”、“ushort”、“int”、“uint”、“float”、“double”或使用
以下之一：

--字符
8 位，有符号

- 字节
8 位，无符号

- 短的
16 位，有符号

--ushort
16 位，无符号

--int
32 位有符号

--uint
32 位无符号

- 漂浮
32 位浮点数

- 双倍的
64 位浮点数

--填充值 , -p
填充值以替换输出图像中检测到的坏切片的数据。 [默认： -一]

- 输出目录 , -o
用于写入带有屏蔽掉的坏切片的图像的文件系统路径（即，填充
填充值）。 [默认： 没有任何]

作者

Torsten Rohlfing，Michael P. Hasak、Greg Jefferis、Calvin R.
Maurer、Daniel B. Russakoff 和 Yaroslav Halchenko

使用 onworks.net 服务在线使用 cmtk-dwi_mask_bad_slices