这是 cpgplote 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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cpgplot - 识别和绘制核苷酸序列中的 CpG 岛
概要
cpg图 -序列 后继 -窗口 整数 -敏伦 整数 -米诺 浮动 -minpc 浮动
-输出文件 输出文件 -阴谋 切换 -图形 xy图 - obsexp 布尔 -cg 布尔
-pc 布尔 -击败 壮举
cpg图 -救命
商品描述
cpg图 是来自 EMBOSS（“欧洲分子生物学公开赛”）的命令行程序
软件套件”）。 它是“Nucleic:CpG Islands”命令组的一部分。
配置
输入 部分
-序列 后继
其他要求 部分
-窗口 整数
CG 含量的百分比和 CG 的观察频率是在一个范围内计算的
其大小由该参数设置的窗口。 窗口按顺序向下移动，
这些统计信息是在窗口移动到的每个位置计算的。 默认
值：100
-敏伦 整数
这设置了 CpG 岛在报告之前必须达到的最小长度。
默认值：200
-米诺 浮动
这设置了一组中 C 加 G 与 CpG 的预期比率的最小平均观察值
报告 CpG 岛之前所需的 10 个窗口。 默认值：0.6
-minpc 浮动
这将设置 G 加 C 的最小平均百分比，一组 10 个窗口是
在报告 CpG 岛之前需要。 默认值：50。
输出 部分
-输出文件 输出文件
这将设置保存输入序列名称报告的文件的名称，CpG
岛参数和找到的任何 CpG 岛的输出详细信息。
-阴谋 切换
默认值：是
-图形 xy图
- obsexp 布尔
如果将其设置为 true，则 C 加 G 的观察到预期比率的图表
显示窗口内的 CpG。 默认值：是
-cg 布尔
如果将其设置为 true，则已确定为的区域图
显示 CpG 岛。 默认值：是
-pc 布尔
如果将其设置为 true，则窗口内的百分比 C 加 G 的图形为
显示。 默认值：是
-击败 壮举
输出特征文件
使用 onworks.net 服务在线使用 cpgplote
