这是命令 dsimulator，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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dsimulator - 为随机基因组生成合成读数
概要
模拟器 绅士：双倍 [-c双 (20。)[-b双倍(.5)[-rINT[-mINT(10000)]
[-sINT(2000)][-xINT(4000)[-e双倍(.15)][-M文件]
商品描述
模拟器 首先生成一个大小的假基因组 绅士* 1Mb 长，具有 AT 偏置
-b. 然后它生成平均长度的样本读数 -m 从对数正态长度
标准差分布 -s，但忽略长度小于 -x。 它
收集足够的读数来覆盖基因组 -c 时代和介绍 -e 将错误分成
每个读取，其中插入、删除和替换的比率由定义设置
generate.c 中的常量 INS_RATE（默认 73%）和 DEL_RATE（默认 20%）。 一罐
还通过以下方式控制从正向和反向链中挑选读取的速率
设置定义的常量 FLIP_RATE（默认 50/50）。 这 -r 选项种子随机
用于生成基因组的数字生成器，以便人们可以可重复地生成
要从中采样的相同基础基因组。 如果缺少此参数，则作业 ID
调用的种子随机数生成器。 输出发送到标准
输出（即它是一个 UNIX 管道）。 输出采用 Pacbio .fasta 格式，适合作为输入
至 fasta2数据库(1). 最后， -M 选项要求每个读取的坐标
已采样写入指定文件，每次读取一行，ASCII 编码。
这个“映射”文件本质上告诉人们每次读取在程序集中的位置，并且非常
用于调试和测试目的。 如果读对是 b,e 那么如果 b < e
read 是从 [b,e] 向前采样的，如果 b > e 从 [e,b] 中
反方向。
使用 onworks.net 服务在线使用 dsimulator
